二手離子色譜系統(tǒng)的構成與HPLC相同，儀器由流動相傳送部分、分離柱、檢測器和數據處理4個部分組成，在需要抑制背景電導的情況下通常還配有MSM或類似抑制器。其主要不同之處是IC的流動相要求耐酸堿腐蝕以及在可與水互溶的有機溶劑（如乙腈、甲醇和丙酮等）中不溶脹的系統(tǒng)。因此，凡是流動相通過的管道、閥門、泵、柱子及接頭等均不宜用不銹鋼材料，而是用耐酸堿腐蝕的PEEK材料的全塑IC系統(tǒng)。離子色譜的重要的部件是分離柱。柱管材料應是惰性的，一般均在室溫下使用。柱和殊性能分離柱的研制成功，是離子色譜迅速發(fā)展的關鍵。